phenotools:用于可视化和分析表型数据集的R包

phenotools:用于可视化和分析表型数据集的R包

本研究引入了一个新的R包phenotools,用于集成(融合原始或遗留数据集)、策划(查找和删除重复项),及可视化表型数据集,植物表型资讯介绍如下:

表型数据对于理解基因型-表型关系、评估生命树以及揭示特征多样性随时间变化的趋势至关重[……]

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分离线性聚类猕猴桃的新型图像处理算法

分离线性聚类猕猴桃的新型图像处理算法

本研究旨在开发一个机器视觉系统,能够在收获前识别植物上的猕猴桃,植物表型资讯介绍如下:

中国是世界上生产猕猴桃(Actinidia chinensis Planch)的最大国家,其中以陕西省的产量最高,约占当地和全球产量的70%和33[……]

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作物遗传资源表型信息系统建模

作物遗传资源表型信息系统建模

本研究描述了支持多站点田间表型数据采集的Web接口综合数据和对象模型,这些数据和对象模型是多年来在欧洲植物遗传资源合作计划中为中央作物数据库所开发的,可作为表型信息系统的研究方案,植物表型资讯介绍如下:

表型信息的记录是生物多样性、作[……]

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适用于葡萄育种的植物器官自动视觉检测方法

适用于葡萄育种的植物器官自动视觉检测方法

本研究为植物的不同生长阶段和不同图像采集程序提供了一个方法,用于在RGB图像中自动检测、定位和计数植物器官,植物表型资讯介绍如下:

葡萄幼苗的周期性和多尺度的田间表型分析、群体图谱或基因库是当今(葡萄)育种计划和研究中最具挑战性的需求[……]

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大数据驱动型农业:植物育种、基因组学和遥感技术提高作物生产力的大数据分析

本报告涵盖了由美国农业部国家食品和农业研究所(NIFA)资助的两个大数据驱动农业研讨会提出的优先事项和建议,植物表型资讯介绍如下:

植物育种和农学都是劳动密集型的科学专业,由于世界人口不断增长,这些领域的科研发展对于攻克随之而来的粮食[……]

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基于关联作图研究的性状本体分析弥合了作物基因组学和表型组学之间的差距

文利用基于关联作图研究的性状相关位点(TAS)信息可用于基因的功能注释、富集分析、性状相关基因的全基因组提取以及不同功能注释数据库的交叉检查,植物表型资讯介绍如下:

性状本体(TO)分析是基因功能注释和富集分析的有力系统。然而,鉴于表[……]

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高粱穗的自动计数和分割

高粱穗的自动计数和分割

本文提出了一种可扩展的高通量方法,通过航拍来自动计算和分割穗,植物表型资讯介绍如下:

表型分析是衡量生物体可观察性状的过程。传统的人工表型分析劳动密集、耗时、成本高且误差较大。为了化解作物育种领域面临的严峻挑战,需要开发出精准、自动化[……]

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利用高光谱叶片反射率表征光合能力:一种基于多机器学习算法的集成方法

本文旨在开发一种全新估算光合能力的方法,植物表型资讯简介如下:

全球农业生产正面临人口增长和气候变化带来的严酷挑战,或许可通过培育转基因作物品种来缓解。目前提高光合能量转换效率的研究提出了许多提高产量的策略,但由于表型发展瓶颈,尚未找[……]

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用于植物育种和精准农业的高通量田间表型工具

用于植物育种和精准农业的高通量田间表型工具

本文旨在强调各种高通量表型方法在植物育种和栽培中的应用及关键差异,同时总结了使用这些技术的文献示例,并着重介绍了关键技术。植物表型资讯简介如下:

近年来,高通量田间表型引起了人们的广泛关注,科学家开发了几种记录植物性状的全新方法。由于[……]

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高通量田间表型评估藜麦灌溉处理效果

高通量田间表型评估藜麦灌溉处理效果

藜麦(Chenopodium quinoa Willd.)是一种以耐旱、耐盐碱等非生物胁迫而闻名的作物,同时也是一种多功能超级食物——不含麸质,富含蛋白质、维生素、营养素和有益的抗氧化物质,本文旨在利用高通量表型技术评价不同灌溉条件下藜麦品[……]

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利用冠层高光谱数据检测小麦叶锈病

利用冠层高光谱数据检测小麦叶锈病

植物病害检测已成为农业领域的一项具有挑战性的工作,本文针对目前各种技术及面临的挑战进行了综述,植物表型资讯简介如下:

植物病害检测已成为农业领域的一项具有挑战性的工作。在病害发生初期对植物影响范围较小,但是随着时间发展,病害便会在更大[……]

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通过油菜高通量表型分析揭示QTL对植物生长发育过程的强时间动力学作用

本文针对利用高通量表型的最新技术进展,结合全基因组关联研究,阐明了高时间分辨率下的基因型-表型关系,植物表型资讯简介如下:

植物生物学的主要挑战是揭示复杂性状的遗传基础。本文针对利用高通量表型的最新技术进展,结合全基因组关联研究,阐明[……]

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对比不同氮肥和基因型鉴定大麦产量相关的性状

对比不同氮肥和基因型鉴定大麦产量相关的性状

本文旨在研究大麦三种基因型、两个杂交种和一个商业品系在氮供应对比下,冠层、叶片和转录水平对作物生长的影响机制,植物表型资讯简介如下:

近年来,科学家对与作物性能相关的性状和潜在生理机制给予了很大的关注,但在结合不同植物规模、观察水平以[……]

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基于无人机高通量表型平台预选玉米表型组分

基于无人机高通量表型平台预选玉米表型组分

本文通过实施自组织映射和主成分分析双图两种方法来建立表型图谱和相似性,提出了一种无人机辅助的HTP框架,用于预选玉米(Zee mays L.)表型组分(或性状),植物表型资讯简介如下:

随着环境恶化、自然资源稀缺和人口迅速增长,人类面[……]

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利用高光谱作为水稻品质蛋白含量的潜在高通量表型分析工具

本文通过高光谱技术结合GWAS分析,对水稻种子的生化特性进行表型分析,植物表型资讯简介如下:

高光谱技术的发展为缩小表型组学和基因组学的差距提供了一种新的分析手段。本文通过高光谱技术结合GWAS分析,对水稻种子的生化特性进行表型分析。[……]

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新型传感器和数据处理方法实现下一代表型组学

新型传感器和数据处理方法实现下一代表型组学

本文旨在针对表型研究领域的一些重要问题发起新的思维和研究活动,并呼吁跨学科共同努力,实现下一代表型组学,植物表型资讯简介如下:

2016年在墨西哥CIMMYT举办的国际植物表型网络(IPPN)第四届国际植物表型研讨会上,讨论了表型传感[……]

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利用高通量测量茎秆性状估算穗密度和地上生物量

利用高通量测量茎秆性状估算穗密度和地上生物量

本研究旨在两个不同位点进行两个实验,对比几种基因型在灌溉和氮处理下生长,植物表型资讯简介如下:

总地上生物量和穗密度是表征小麦基因型的两个重要参数。然而,这种相关性可能取决于环境条件以及作物基因型。此前已有一些研究报告了穗和茎密度在小[……]

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用于植物育种的表型技术的模型策略

用于植物育种的表型技术的模型策略

近日,瓦赫宁根大学著名数量遗传学和模型专家Fred van Eeuwijk联合澳大利亚CSIRO、昆士兰大学著名模型和表型专家Scott Chapman、法国农科院著名表型专家Francois Tardieu等人,撰写了一篇关于用于植物育种[……]

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利用田间半球视频分析量化谷类作物的运动

利用田间半球视频分析量化谷类作物的运动

本文提出了一种图像分析方法和一个信号处理系统,用以分析量化谷类作物的运动,植物表型资讯介绍如下:

直立生长的作物因风、雹、暴雨等自然因素或外力影响导致茎秆剧烈运动、成片歪斜、甚至全株匍倒在地,这种现象被称为倒伏,对燕麦、大麦和小麦等冷[……]

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电阻抗断层成像

电阻抗断层成像

本研究使用电阻抗断层成像(EIT)来观察园艺堆肥中的油菜根系发育,植物表型资讯介绍如下:

植物根系是复杂的三维结构,在根际微生物的固定、水分和养分获取、贮藏以及与根际微生物的相互作用中起着重要作用。由于土壤不是透明的介质,研究植物根系[……]

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比较不同的田间播种方法对小麦表型分析精度的影响

比较不同的田间播种方法对小麦表型分析精度的影响

本研究的目的比较三种种植方法:新型挖洞播种、播种机播种以及手工播种,以确定最有效的田间精确表型分析方法。表型资讯如下:

在进行田间试验时,由于植物的林分不均匀,在预测植物表型与基因型之间的相关性时会产生较大的误差。在造成实验误差的因素[……]

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亚细胞表型分析:利用蛋白质组学定量分析豌豆亚细胞叶蛋白与细胞器分布

本研究的目的是开发一种方法来估计细胞器功能化学计量,并以高通量的方式确定品种内部和跨品种差异的亚细胞动力学。植物表型资讯介绍如下:

迄今为止,植物表型分析通常包括以高通量方式进行的形态分析和生理分析,缺少一种能够对细胞器化学计量及功能[……]

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用于预测芸薹属花期耐热和耐旱性的非破坏性表型工具

本文利用非破坏性表型工具预测了芸薹属植物花期耐热和耐旱性,其植物表型资讯介绍如下:

芸苔属植物易受到高温和干旱胁迫的影响,特别是在早期生殖阶段。本研究评估了12个芸苔属基因型(G)在整株植物和花组织水平上的成像、叶片气孔导度、叶和芽温[……]

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以光合特性为指标进行城市和城郊森林的表型分析

以光合特性为指标进行城市和城郊森林的表型分析

与光合作用相关的功能性状的表型分析可能是研究都市绿色基础设施性能的一种很有前景的方法。其植物表型资讯介绍如下:

植物表型分析是测量与植物结构或功能相关的特定性状的方法学和方案应用,具有从细胞到整个植物水平的特征。常用于高产作物的育种研[……]

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利用三波段光谱指数分析水稻旗叶氮素含量

利用三波段光谱指数分析水稻旗叶氮素含量

叶氮含量(LNC)已被确定为决定光合能力的关键植物性状。准确、快速、无损测量水稻旗叶氮含量(LNC)对遗传学家和育种工作者具有重要意义。本文提出了一款价格低廉、无损、且能够实时测量LNC的传感器,植物表型资讯介绍如下:

21世纪作物研[……]

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利用3D LiDAR点云对玉米植株进行田间高通量表型分析

利用3D LiDAR点云对玉米植株进行田间高通量表型分析

本文提出了一种利用传感原理的田间高通量表型分析解决方案,植物表型资讯介绍如下:

随着全球人口的迅速增长,科学家们迫切需要改良育种技术以大幅度提高世界粮食产量的需求。大多数研究人员认为,新兴育种技术的关键在于作物的遗传改良,这一过程可产[……]

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一种用于葡萄园产量估算的低成本自动图像识别方法

一种用于葡萄园产量估算的低成本自动图像识别方法

本研究利用非侵入性机器视觉方法快速评估葡萄产量,植物表型资讯介绍如下:

产量预测是优化葡萄园管理、实现理想葡萄品质的关键因素。传统产量评估方法是在收割前对有限数量的植株进行人工采样,这种方法费时且往往无法获得有代表性的产量数据。因此,[……]

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µCT性状分析揭示驯化谷物与其野生近缘种之间的形态差异

本文利用x射线显微计算机断层扫描(µCT)成像技术与定制的图像分析工具和数学模型相结合,研究了野生和驯化小麦、大麦的粒径及粒形的变化,植物表型资讯介绍如下:

小麦和大麦是在肥沃月弯地带驯化的两种主要作物,在温带地区具有重要的经济价值。[……]

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