从表型到表型组学:葡萄性状分析的现状与展望

从表型到表型组学:葡萄性状分析的现状与展望

本文主要聚焦于大规模遗传学研究,如QTL定位,描述了当前的表型方法及其局限性,并介绍了表型学未来的机遇,包括促进公平的数据原则的可发现性,可访问性,互操作性以及可重用性,植物表型资讯介绍如下:

葡萄表型是对葡萄生长、发育、耐受性、抗性、结构、生理、化学、生态学和产量等性状定性和定量评估。通常表型技术依赖于专家以低通量的方式对视觉、化学、生理或其他特征的测量。利用标准化OIV(或物候描述符)和量表对葡萄表型性状进行描述,为表型标准的国际采用和结果的交叉比较提供了良好基础。然而,许多描述符具有主观性,不能捕捉到完整的性状变异,或者可能与某些研究无关。表型组学,即表型的未来,在提高通量、客观性、精确度、动态测量和以及集成方面带来了机遇的同时也带来挑战:需要新的方法来标准化、数据管理和分析。本文主要聚焦于大规模遗传学研究,如QTL定位,描述了当前的表型方法及其局限性,并介绍了表型学未来的机遇,包括促进公平的数据原则的可发现性,可访问性,互操作性以及可重用性

1

各种抗白粉病表型的方法和响应变量

2

一项用于评估葡萄中不同表型的代表性分子技术的调查

 

来源:

Cadle-Davidson L, Londo J, Martinez D, et al. From Phenotyping to Phenomics: Present and Future Approaches in Grape Trait Analysis to Inform Grape Gene Function. The Grape Genome,Compendium of Plant Genomes, https://doi.org/10.1007/978-3-030-18601-2_10

 

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