不同基因型水稻的图像表型分析

本研究旨在鉴别耐旱和易感基因型水稻,植物表型资讯介绍如下。

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在气候变化的背景下,培育高产、耐旱/抗旱水稻品种是世界面临的一项重要挑战。以大米为主食的亚非等发展中国家,如印度、中国对此类水稻品种的需求更为明显。本研究旨在鉴别耐旱和易感基因型水稻。
3(a)对于处于对照(顶部)和干旱(底部)条件下的基因型,植物凸包的叶数和每单位面积的叶数变化。(b)该图显示了在胁迫期间(35至55 DAT),在对照和干旱条件下,Anjali基因型的叶片数变化新德里印度农业研究理事会-印度农业研究所Nanaji Deshmukh植物表型学中心的研究人员,在受控条件下,利用高通量植物表型组学设施对150个基因型水稻品种进行评估。。为了区分基因型,研究人员考虑了一些特征,如每株植物的叶片数、通过连接叶尖形成的植物凸包和凸包面积、每单位凸包植物的叶片数、冠层伸展-垂直伸展和植物水平伸展。训练You Only Look Once(YOLO)深度学习算法,用于检测和估计水稻植株中的叶片数量。利用提出的框架,根据选择的性状筛选基因型。最后,利用Ward聚类方法将这些基因型进一步划分为耐旱型和抗旱型两大类。

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用Dendogram构建水稻10个基因型的向心聚类方法区分干旱和非干旱基因型

 

来源:

Vishal M K, Tamboli D, Patil A. IMAGE-BASED PHENOTYPING OF DIVERSE RICE (Oryza Sativa L.) GENOTYPES.

 

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