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美国“农业基因组到表型组计划(AG2PI)”即将实施

美国“农业基因组到表型组计划(AG2PI)”即将实施

  • 分类:行业新闻
  • 作者:慧诺瑞德
  • 来源:植物表型圈
  • 发布时间:2020-10-23 11:04
  • 访问量:

【概要描述】

美国“农业基因组到表型组计划(AG2PI)”即将实施

【概要描述】

  • 分类:行业新闻
  • 作者:慧诺瑞德
  • 来源:植物表型圈
  • 发布时间:2020-10-23 11:04
  • 访问量:
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为了应对日益增长的全球人口和多种环境胁迫源对农业生产的挑战,我们必须更好地了解基因型(G)和环境(E)对作物和牲畜复杂表型性状的影响。由于基因型对环境变化的反应不同,导致对表型的影响变得更加复杂。为了准确预测并开发出期望的表型性状,必须了解基因型与环境(GxE)之间的相互作用。因此需要跨学科的研究团队,包括作物和畜牧科学、遗传学、基因组学、计算和数据科学以及工程学。为此,美国国会建立了“农业基因组到表型组计划”(Agricultural Genome to Phenome Initiative, AG2PI)

 

该项目的重点是建立跨领域研究社区,以应对基因组到表型组(G2P)研究的挑战。虽然不同领域已经开始各自应对挑战,但仍有机会共同努力,找出共有的重大研究空白,包括分享和获取数据的机制和技术;多种来源和数据类型的集成;获得数据科学方面的先进网络基础设施和专业知识;新型传感器、机器人、成像平台的发展以及最佳实践的分享。

 

AG2PI旨在进一步加强各个领域之前的联系,为G2P研究确定一个共同愿景,从而解决共同的问题。为实现这一总体目标,本项目将:

  • 确定共同愿景;
  • 确定研究需求、机会和方法、技术、物理基础设施和数据管理方面的差距;
  • 支持种子项目,解决现存挑战
  • 通过白皮书、网站和其他科学出版物来传播研究成果;

 

为了应对在作物和牲畜中实现可持续遗传改良的挑战,需要各领域研究人员的专业知识。为此,AG2PI团队与跨机构和国家的不同组织合作,了解并分享各自的思想、方法和工具。

 

为了促进跨学科社区的发展,AG2PI将举办四种类型的活动:虚拟田间活动日、会议、培训研讨会和种子赞助基金

 

田间活动日:

为了让G2P社区了解农作物和牲畜研究活动和资源的多样性,我们将举办虚拟田间活动日。该活动侧重于分享研究方法并确定研究差距和挑战。如果您有兴趣举办一个田间活动日,请与我们联系,我们为报告人提供如何跨学科交流的培训课程。

 

会议:

为了找出知识、基础设施、等方面的差距以及G2P圈内机会,我们将召开会议。大多数会议主题将集中讨论跨物种边界,如网络基础设施、生物信息学、成像、数据存储、共享和再利用、统计等,也有一些会议主题侧重于特定物种(如玉米或牛)。会议将与相关的培训研讨会(见下文)相结合,并由与会者在网上合作起草白皮书。我们还将举办各种活动,介绍G2P为社区成员提供资助机会。

 

培训研讨会:

为了建立技术优势和未来合作的G2P圈,我们将提供培训研讨会,使来自不同背景和计算技能水平的研究人员能够围绕基因组和表型网络基础设施、数据工具和管道、统计数据,开发最佳实践、通用词汇和技术专长以及实验技术。所有研讨会都将以虚拟网络方式进行,以次增加可及性和参与度。

 

种子赞助基金:

AG2PI的“种子资助计划”旨在促进协作并支持工具、数据和思想的开发和交叉,以支持和促进未来跨学科、跨物种和跨领域的G2P研究。针对与G2P相关的主题,种子赞助基金金额从5,000-10,000美元不等,有效期为6-12个月。考虑到赞助金的金额,可交付成果可以为雏形,而不是已完成的研究项目。根据美国AG2PI RFA,任何机构都将有资格申请种子赞助基金。

 

2020年10月28日10:30-12:00(美国中部时间),AG2PI将进行线上介绍会。会议议程如下:

 

 

在AG2PI项目介绍会结束后,项目组会将会议视频发送给百博智慧大讲堂,在大讲堂频道重播,敬请期待!

 

(扫描二维码可观看AG2PI项目介绍会视频回放)
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