成熟荚色(PC)和荚果大小(PS)是大豆育种的重要性状。然而，对这些复杂的性状进行人工表型分析费时、费力且价格昂贵。本研究收集了两个不同种群的荚果图像，即一个由187份种质组成的大豆联合组(SAP)和一个包含284个RIL的种间重组自交系(RIL)种群。研究人员提出了一种基于图像表型分析方法，用于从图像中提取荚果颜色和大小相关参数。

两个群体性状的皮尔逊相关

SAP荚果大小相关性状的曼哈顿关联图分析

首先，采用全基因组关联分析(GWAS)和连锁作图技术，对荚果颜色和大小相关性状的遗传控制进行研究。这两个种群在荚果颜色和大小相关性状上表现出广泛的表型变异和连续分布，表明这些性状具有数量上的多基因遗传。GWAS和连锁作图方法鉴定出两个主要的荚果颜色QTL (qPC3和qPC19)，分别位于第3和第19条染色体上，9条染色体上有12个荚果大小相关性状的稳定QTL。基于基因注释和表达谱数据，在稳定QTL的基因组区域内的几个基因被确定为潜在的候选基因。综上所述，本研究结果为QTL的精细定位/图位克隆和分子标记辅助选择具有理想荚果性状的优良品种提供了有用信息。

NJRINP两个主要控制果色位点的QTL图谱

来源：

Chang F, Lv W, Lv P, et al. Exploring genetic architecture for pod-related traits in soybean using image-based phenotyping. Molecular Breeding volume. https://doi.org/10.1007/s11032-021-01223-2.