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花生种皮颜色的QTL定位及QTL×环境互作分析

花生种皮颜色的QTL定位及QTL×环境互作分析

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
  • 发布时间:2021-08-11 06:10
  • 访问量:

【概要描述】为探讨花生种皮颜色的遗传机制,本文利用三维参数、红(R)、绿(G)和蓝(B)值对该性状进行了界定。

花生种皮颜色的QTL定位及QTL×环境互作分析

【概要描述】为探讨花生种皮颜色的遗传机制,本文利用三维参数、红(R)、绿(G)和蓝(B)值对该性状进行了界定。

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
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为探讨花生种皮颜色的遗传机制,本文利用三维参数、红(R)、绿(G)和蓝(B)值对该性状进行了界定。

 

亲本和RIL群体中种皮颜色的表型变异

 

三种环境中RIL种群种皮颜色的频率分布

 

首先,从3个环境中收集了一个重组自交系群体的图像表型数据,多数表现为连续分布和海侵分离。RGB值与广义遗传力之间的显著正相关分别为0.84、0.94和0.87。然后,基于先前的高密度遗传图谱,进行了数量性状位点(QTL)定位。个体环境分析产生了8个相关的QTL,解释了从3.29%到35.94%的表型变异。在3号染色体上发现了一个稳定一致的R和G值区域,覆盖了116.78 ~ 118.94 Mb的基因组区域。多环境联合分析鉴定出12个加性qtl,表型变异解释率(PVE)为1.88%~34.65%。共鉴定出23对上位性qtl,涉及30个位点,用于调控种皮颜色的RGB值。综上所述,功能注释有助于挖掘一致QTL区域中种皮颜色的候选基因。

 

利用RIL群体在不同环境下检测种皮颜色的QTL

 

来源:

Zhang S, Hu X, Miao H, et al. Imaged-based phenotyping accelerated QTL mapping and qtl × environment interaction analysis of testa colour in peanut (Arachis hypogaea). Plants Breeding. https://doi.org/10.1111/pbr.12905.

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