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高通量表型在基因组选择中的应用

高通量表型在基因组选择中的应用

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
  • 发布时间:2021-08-23 06:10
  • 访问量:

【概要描述】本文概述了HTTPs数据的统计分析,从而提高传统GS模型的预测能力。

高通量表型在基因组选择中的应用

【概要描述】本文概述了HTTPs数据的统计分析,从而提高传统GS模型的预测能力。

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
  • 发布时间:2021-08-23 06:10
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育种家面临的最大挑战之一是在不断变化的气候条件下培育改良品种。通过自动化系统生成数据的可用性为高度详细地描述遗传和表型基因型提供了一个机会。现代测序技术无需现场观察,但可以进行数十万个分子标记,提供选择基因型的机会这种方法被称为基因组选择(GS)。最近,研究人员还开发了依赖于能够测量大量植物特征的传感器的复杂自动表型平台,该平台在植物育种显示不凡的应用潜力。这些试图有效地传递次级性状表型信息的现代表型分析系统也被称为高通量表型分析平台(HTPP)。结合HTPP与GS模型开辟了新的研究前沿,以提高仅基于基因组数据的选择方法的效率,特别是那些依赖于大量小效应基因(复杂性状)的性状。然而,要开发一种健壮的、能够以有效和知情的方式组合这两种高维数据类型的方法,仍然存在一些问题需要解决。本文概述了HTTPs数据的统计分析,从而提高传统GS模型的预测能力。

 

首先,本文简要介绍了基因组数据在植物育种中的应用。然后,概述了基于现场的HTPP,考虑到雷达以及无人机,以及如何使用从这些平台获得的图像数据加速遗传增益。接着,讨论了传统GS模型的扩展,以允许将HTPPs得出的数据作为主要效应纳入,并与环境因素相互作用。除了单变量或单性状模型、基于多性状的模型以及考虑多种时间测量的模型外,多种信息来源的可用性为研究提供了场所。最后,我们给出了一些结论,并提到了一些当前不允许充分利用HTTPs在植物育种应用中的潜力的问题。

 

来源:

RPersa R, Ribeiro P and Jarquin D. The use of high-throughput phenotyping in genomic selection context. Crop Breed. Appl. Biotechnol. 21 (spe) • 2021 • https://doi.org/10.1590/1984-70332021v21Sa19.

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