基于形态结构模型的水稻植株三维动态可视化模拟及其在表型计算中的应用


发布时间:

2025-01-16

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虚拟作物是作物模型研究领域的重要内容,已成为探索作物表型不可缺少的工具。这项工作的重点目标是实现水稻个体和水稻群体的三维(three-dimensional,3D)动态可视化模拟,以及利用虚拟水稻预测水稻表型。利用实验室现有的研究成果,通过整合水稻植株地上部分与根系的同步关系,实现了水稻个体和群体在不同生长程度日(growth degree days,GDD)的三维动态可视化。所得到的可视化效果逼真,对水稻形态变化具有较好的预测能力。2019年,在安徽省进行了田间试验,获得了2个不同水稻品种分蘖期、拔节期和开花期叶面积指数数据。采用基于虚拟水稻模型的叶片分割方法预测水稻叶面积指数。实测叶面积指数与模拟叶面积指数的相对误差为7.58% ~ 12.69%。计算出均方根误差、平均绝对误差和决定系数分别为0.56、0.55和0.86。所有的评价标准都显示出值得赞扬的准确性。这些进展为虚拟作物的开发和作物表型预测提供了技术和模型支持。

 

图1  本研究的基本研究框架。

 

图2  水稻植株主茎的基本结构。

 

图3  水稻叶片分割结构图。

 

图4  低氮水平下不同生育期YD6地上部分三维可视化。

 

图5  正常氮素水平下不同生育期YD6地上部分三维可视化。

 

图6  低氮水平下W14不同生育期地上部分三维可视化。

 

图7  正常氮水平下不同生育期W14地上部分三维可视化。

 

图8  正常水氮条件下水稻植株播后不同天数YD6根系三维可视化。

 

图9  水稻W14在正常水分和不同氮素条件下播后40 d根系三维可视化。

 

图10  正常施氮水平下YD6水稻不同生育期全株三维可视化。

 

图11  YD6不同生育期植物种群三维可视化。

 

图12  YD6成熟期种群实景图。

 

图13  所有实测和模拟LAI之间的比较。Nsp是每个叶子的分裂数。

 

来 源

Zhang Y, Zhang Y, Zhang P, Tang L, Liu X, et al. (2024) The 3D dynamic visualization simulation of rice plant based on morphological structure model and the application in phenotypic calculation. PLOS ONE 19(11): e0309052.

 

编辑

王春颖

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