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受控环境下的高通量表型分析和人工智能
发布时间:
2025-04-18
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植物表型组学涉及受控环境农业 (controlled environment agriculture,CEA) 中与遗传和环境变异相关的植物表型的测量。它涵盖从分子生物学到生态系统级研究的一系列领域,采用高通量表型分析 (high-throughput phenotyping,HTP) 方法来快速评估特性并提高智能植物工厂中作物的产量。HTP 使用环境参数来提高准确性,例如软件传感器,以及用于色素数据的高光谱成像、用于含水量的热成像和用于光合作用速率的荧光成像。它们提供有关生长动力学、生理和生化特征以及基因型与环境相互作用的信息。人工智能 (AI) 和机器学习 (ML) 用于大量表型数据,以预测生长率、确定浇水植物的最佳时间或在早期检测疾病、营养缺乏或害虫。智能植物工厂使用的照明是根据植物的特定生长阶段进行调整的,例如在发芽、营养生长和开花阶段使用不同的光强度、光谱和持续时间,使用水培法提供营养,使用 CRISPR(原核生物基因组内的一段重复序列)来改善某些特性,例如抗旱性。这些系统通过优化环境和利用精准育种技术来提高作物的产量、单产、适应性和投入利用率。植物表型组学结合人工智能是多学科的结合,促进了对植物与环境相互作用与农业问题(如资源利用、疾病和气候变化)的理解。它影响着它们开发作物的能力,这些作物可以吸收投入、最大限度地减少化学药剂的使用,并能抵御气候变化。表型组学具有成本效益,可以减少投入,有助于实现更可持续的农业实践,既经济又环保。总而言之,植物表型组学是 CEA 的核心,因为它能够利用农业中的表型数据和遗传潜力来促进可持续发展和粮食安全。通过表型组学研究,接下来的进展可能会对全球农业实践和粮食系统产生更大的革命性影响。
图1 高通量表型分析创新模型。(A)成像技术:该面板说明了表型分析中使用的各种成像技术。高光谱成像用于分析植物的健康和成分。热成像评估植物的水分状况和胁迫。荧光成像监测光合作用并检测早期胁迫或疾病。(B)传感器技术:该面板说明了表型分析中使用的各种类型的传感器。环境传感器测量光照、温度、湿度和二氧化碳水平,而土壤传感器监测 pH 值和营养水平。植物传感器监测叶面积、生长率和叶绿素含量。(C)数据处理和分析:该面板详细介绍了从数据收集到预测建模的工作流程。它包括数据预处理、特征提取以及应用高级算法和机器学习模型来预测和分析表型性状。
图2 植物表型学中人工智能 (AI) 和机器学习 (ML) 整合的拟议模型。数据采集涉及使用先进的成像和传感器技术(包括高光谱、多光谱、热成像和 3D 成像)从各种植物性状中收集高通量表型数据。进行数据预处理以消除噪声、规范化和对齐数据集。特征提取,从处理后的数据中识别关键性状和特征。模型训练,将处理后的数据输入 AI 和 ML 算法以识别模式和相关性,使用深度学习、卷积神经网络 (CNN) 和支持向量机 (SVM) 等关键技术对性状进行分类并预测结果。预测,重点是使用训练后的模型预测植物在各种环境条件下的表现并识别与特定表型相关的关键遗传标记。模型应用,涉及将这些预测应用于新数据集以进行实时表型分析、决策和植物育种。反馈循环,通过整合新数据和改进预测来不断改进模型,将人工智能驱动的洞察力融入精准农业实践中,以优化资源利用并提高作物的恢复力。
Kaya, C. (2025), Optimizing Crop Production With Plant Phenomics Through High-Throughput Phenotyping and AI in Controlled Environments. Food Energy Security, 14: e70050.
编辑
王春颖
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