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表型组学驱动的结缕草抗旱性研究
发布时间:
2025-09-03
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图1 在Tifton,GA的结缕草种群中的实地研究的航空图像。定义个体地块边界的多边形覆盖在航空图像上,地块大小为0.6 × 0.6 m。
图2 来自Tifton,GA研究地点的天气数据,包括(a)平均气温和蒸汽压差,(b)2023年5月1日至9月28日降水量、蒸散量和土壤水分的差值(图中红色阴影部分),以评估结缕草群体的干旱响应。(b)中的粉红色箭头表示三个采样日期(2023年6月7日、8月3日和8月21日)进行高光谱图像采集。
图3 基于sUAS的高光谱成像工作流程,包括数据收集、预处理和绘图级提取。AGL,地面水平;GSD,地面采样距离;NDVI,归一化差异植被指数;RTK GNSS,实时动态全球导航卫星系统。
图4 2023年8月3日和8月21日,在Tifton,GA的结缕草群体中,235个结缕草的视觉草坪草质量(TQ)。表现最好的组和表现较差的组,每个组包含10个基因型,分别以绿色和棕色突出显示(a),具有标准误差。代表表现最好、较差和中等的组的三个基因型突出显示(B)在绿色中,在8月21日,前10个抗旱基因型被选为视觉TQ最高的统计组,并且在前18天内视觉TQ下降最小(8月3日至8月21日)。表现较差的10种基因型在8月21日被确定为视觉TQ最低统计组,在同一时期,视觉TQ的下降幅度最大。
图5 光谱反射率(a)(实线)及其变异系数(CV,%,黑色虚线),通过基于sUAS的高光谱相机在三个采样日期收集的235个结缕草基因型中的结缕草群体:2023年6月7日(D1)、8月3日(D2)和8月21日(D3)。表现最好和表现最差的组,每组包含10个基因型,用绿色和棕色线突出显示,8月21日,前10个抗旱基因型被选为草坪草视觉质量(TQ)最高的统计组,在前18天内视觉TQ下降最小(8月3日至8月21日)。表现较差的10种基因型在8月21日被确定为视觉TQ最低统计组,在同一时期,视觉TQ的降低最大。配对t检验p值的热图(b),比较表现最佳组和表现较差组的反射率,其中较浅的阴影表示更显著的差异。
图6 直方图和密度图显示了在三个采样日期,结缕草种群中植被指数(VIs)的分布:(2023年6月7日;绿色),D2(2023年8月3日;紫色)和D3(2023年8月21日;棕色)。垂直虚线表示三种代表性基因型的值:19-TZ-14434(紫色)、19-TZ-14537(蓝色)和19-TZ-14539(绿色),沿着两个亲本Meyer(灰色)和PI 231146(黑色),在D3。MRENDVI,修正的红边归一化差异植被指数;NDRE,归一化差异红边指数;NDVI,归一化差异植被指数;PRI,光化学反射指数;PSRI,植物衰老反射指数;RENDVI,红边归一化差异植被指数;SIPI,结构不敏感色素指数;WBI,水带指数;WINDVI,WBI与NDVI的比值。
图7 通过基于sUAS的高光谱相机在由235种基因型组成的结缕草种群中收集的选定指数,采样日期为:2023年6月7日(D1)、8月3日(D2)和8月21日(D3)。来自表现最好的组的基因型19-TZ-14539,来自表现较差的组的基因型19-TZ-14537,来自中间组的19-TZ-14434分别以绿色、棕色和紫色线突出显示,并带有标准误差。红色 * 表示在给定日期三种基因型之间存在统计学差异。父母Meyer和PI 231146分别以黑色实线和虚线突出显示。
图8 从sUAS的高光谱图像估计可见草坪质量(TQ)的弹性网络回归模型的性能和模型系数。散点图比较预测与观察到的视觉TQ使用模型建立在全光谱反射率(a)和选定的植被指数(B),与各自的均方根误差(RMSE),R2,面板(c)和(d)显示了模型系数,突出了弹性网络模型中最具影响力的光谱波长(c)和植被指数(d)。
Zhang, J., Maleski, J., Khanal, S., Webb, A., Schwartz, B., Conner, J., Gouveia, B. T., Milla-Lewis, S., Patton, A. J., & Huang, B. (2025) Phenomics-driven insights into zoysiagrass drought resistance using small unmanned aircraft systems (sUAS)-based hyperspectral images. The Plant Phenome Journal, 8, e70027.
编辑
王春颖
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