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一种低成本、高通量的普通豆种的种皮色差定量方法

一种低成本、高通量的普通豆种的种皮色差定量方法

  • 分类:学术中心
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:植物表型资讯
  • 发布时间:2022-12-06 13:35
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【概要描述】

一种低成本、高通量的普通豆种的种皮色差定量方法

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种子表型通常使用视觉评估进行,该评估存在主观性。在本研究中,我们使用基于L*,a*,b*和δ E的种子颜色定量的低成本光谱方法对278种喜马拉雅西部豆种质进行表型分析。所有七个颜色等级的L*、a*、b*和δ E参数都存在很大差异,如图1到图5。L* 的平均值在红色(31.31)中最低,在白色(78.17)中最高,在 a* 的情况下则相反。同样,b*的平均值在黑色中最低(-0.29),在黄色中最高(40.86)。就δ E描述的标准颜色的偏差而言,红色(6012.16)的平均值最高,绿色(18.36)的平均值最低,所有颜色的平均值为2525.72。前两个主成分占变异的86.74%。在PC1中按颜色和L*贡献,在PC2中按b*,L*和a*贡献,如图6。在本研究中,基于因子载荷图,颜色与L*密切相关,这从其在PC1和PC2中的显着贡献中可见一斑。多变量分析清楚地将 278 个基因型的多样性面板划分为不同的颜色组,如图7,如根据 L*、a* 和 b* 值将相似颜色类别的基因型集中在双标图四个坐标的特定区域以及它们与颜色评分的关系如图8所示。该方法消除了视觉颜色规格的主观性,是定量的,可以帮助精确量化品种差异。

 

图1 278份大豆种质中不同颜色等级的频率分布

 

图2 描述颜色感知的CIE L*a*b*颜色空间

 

图3 用于计算δE值的参考颜色的L*a*b*值

 

图4 各种颜色类别中L*a*和b*值变化的图形表示以及整体多样性面板

 

图5 254种豆类基因型七种种子颜色δE值的变异

 

图6 普通豆类种子颜色和L*a*b*变量的PCA双图

 

图7 显示基因型分类为各种簇的树状图

 

图8 根据喜马拉雅西部豆类种质中不同颜色类别的L*a*b*值进行颜色定量

 

来 源

Parvaze Ahmad Sofi, Ramsha Khalid, Sadiah Shafi, Aaqif Zaffar, Sajad Majeed Zargar. A Low cost and high throughput spectroscopic method for quantification of seed coat colour differences in plain seeded bean (Phaseolus vulgaris L.) germplasm from Western Himalayan Kashmir. https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-2244758/v1

 

编 辑

王春颖

 

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