学术中心
本章来自书籍《Towards Responsible Plant Data Linkage: Data Challenges for Agricultural Research and Development》（图1），描述了一个集成数据框架的进展，该框架支持由英国BBSRC资助的设计未来小麦战略研究项目(Designing Future Wheat，DFW)的数据共享。
DFW是一个为期5年的项目(https://designingfuturewheat.org.uk/)，跨越8个研究机构和大学，旨在向育种者提供育种前的种质资源，以改善和增加他们育种项目的遗传多样性。DFW致力于通过采用FAIR（可查找、可访问、可互操作、可重用：Findable, Accessible, Interoperable, Reusable）数据共享方法，使其数据向更广泛的研究界开放。它也是数据密集型战略研究方案的一个很好的例子，该方案遵循“从田间到实验室再到田间”的循环方法，这是许多当代和多学科作物科学研究的代表。然而，即使有专门的资金来开发作物数据研究基础设施，我们发现仍然存在许多挑战，需要实用而灵活的方法来实现它们的互操作。提出了关键的DFW数据资源作为一个案例研究，以评估进展和讨论这些挑战，以期满足FAIR原则的基础设施，开发元数据丰富的数据集。
DFW资助的主要数据资源：
CerealsDB：www.cerealsdb.uk.net
KnetMiner：https://knetminer.com/Triticum_aestivum
Wheat Expression Browser：www.wheat-expression.com
Wheat Germplasm Resource：www.seedstor.ac.uk
Ensembl Plants – Wheat：plants.ensembl.org/Triticum_aestivum
DFW Field Trials：grassroots.tools/dfw
DFW Data Portal：opendata.earlham.ac.uk/wheat
DFW Digital Repository：ckan.grassroots.tools
来 源
Rawlings, C.J., Davey, R.P. (2023). From Farm to FAIR: The Trials of Linking and Sharing Wheat Research Data. In: Williamson, H.F., Leonelli, S. (eds) Towards Responsible Plant Data Linkage: Data Challenges for Agricultural Research and Development. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-031-13276-6_6
编 辑
王春颖
扩展阅读
扫二维码用手机看
推荐新闻
发布时间 : 2022-11-13 07:26:55
发布时间 : 2022-05-20 11:45:57
发布时间 : 2022-05-13 10:56:43
视频展示
专题报道
联系我们
慧诺瑞德（北京）科技有限公司
地址：北京市海淀区西三旗街道建材城中路12号院8号楼2门
电话：010-62925490、82928854、82928864、82928874、18600875228
传真：010-62925490-802
Email: info@phenotrait.com
邮编：100096
在线留言
关注我们
植物表型圈
植物表型资讯
慧诺瑞德（北京）科技有限公司版权所有 京ICP备15043840号 网站建设：中企动力 北二分 法律声明