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HeliantHOME，开源且集成的向日葵表型数据集

分类：学术中心
作者：PhenoTrait
来源：植物表型资讯
发布时间：2023-01-09 09:35
访问量：

【概要描述】

HeliantHOME，开源且集成的向日葵表型数据集

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作者：PhenoTrait
来源：植物表型资讯
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基因组学的研究通常试图将自然遗传变异与重要的表型变异联系起来。为得到值得信任的结果，通常需要可靠稳定的表型数据以及精心筛选的基因组序列。原产于北美洲的野生向日葵通常适应于多种多样且极端的环境，它在历史上一直是被广泛使用的模式植物，用来研究种群基因组学、适应性和物种形成。此外，从野生向日葵驯化而来的人工栽培向日葵是一种全球性油料作物，在全球植物油产量中排名第四。对于植物科学界和相关农业部门来说，数据资源的公开可用性是极其宝贵的。本研究创建了一个精心策划的、公开的、交互式的表型数据库HeliantHOME(http://www.helianthome.org)，其包括从大量野生和人工栽培向日葵个体中获得的发育、结构和环境表型。此外，该数据库还丰富了外部基因组数据和全基因组关联研究的结果。最后，作为一个社区开源平台，HeliantHOME希望随着新知识和资源的提供而扩展。

图1 野生向日葵种群分布。图中显示了HeliantHOME中研究的野生向日葵种群分布，对应于四种不同的物种：橙色的Helianthus annuus、绿色的Helianth argophyllus、紫色的Heliannthus nivus和蓝色的Helians petiolaris。

图2 HeliantHOME提供的具有遗传多样性的向日葵高分辨率图像。

图3 HeliantHOME登录页面(http://www.helianthome.org)

图4 表型概述。详细表型信息在 (http://www.helianthome.org/phenotype/1/)，更多功能和介绍可在上述网站中探索。

图1 XXXXXXXX

来源

Bercovich N, Genze N, Todesco M, et al. HeliantHOME, a public and centralized database of phenotypic sunflower data[J]. Scientific Data, 2022, 9(1): 1-9.

编辑

刘昕哲

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