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利用P-TRAP软件分析122个水稻RIL的穗部结构

发布时间：

2023-02-10

来源：

植物表型资讯

作者：

PhenoTrait

水稻穗的结构对育种至关重要，因为它直接影响每穗的粒数，因此，水稻的总产量也受到影响。水稻品种在形态特征（如穗的复杂性）、生态、环境、非生物和生物胁迫耐受性方面也有所不同。为了最大化水稻穗资源的多样性，必须定义和测量穗的形态特征。这包括对大量材料进行筛选，寻找新的有趣特征，并访问现有的表型数据，以确定其多样性中涉及的基因，从而将这些基因用于植物育种。人工表型测量通常会损害植株，使得无法评估同一穗的所有特征。考虑到基因发现和作物开发的重要性，将此类耗时费力的操作自动化至关重要。

利用穗性状表型分析工具（P-TRAP）分析水稻穗部结构是生成全面和可复制的穗结构数据和识别优良育种系的方法之一。本研究使用P-TRAP软件分析了122个RIL及其亲本的水稻穗结构，评估了9个小穗特征及其对粮食产量的影响。所有性状都具有显著的相关性，并直接影响粮食产量。结果表明，除小穗数、小穗面积和籽粒产量外，大多数性状的变异系数都较低。与其他性状相比，小穗数和籽粒产量的标准误差值更大。为了更好地了解它们的遗传基础，这些数量性状可以用于全基因组关联分析。P-TRAP是分析这些特征的首选工具，因为与传统方法相比，它减少了人力并在更短的时间跨度内提供丰富的数据。

图1基于122个品系及其亲本（P1 Danteshwari和P2 Dagad deshi）的9个谷物系列密度的直方图

图2 水稻穗部的检测和定量

图3 稻穗的检测和定量——Dagad deshi

来源

Prakash H. P., Rawte S., Saxena R. R.et al. Analyzing rice (Oryza sativa L.) panicle structure of 122 RILs using P-TRAP software for spikelet related traits. Electronic Journal of Plant Breeding, 2022, 13(4), 1226-1233.

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Phenotypic researcher

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