基于YOLOv5单阶段检测器检测番茄植株表型特征


发布时间:

2023-04-22

来源:

植物表型资讯

作者:

PhenoTrait

本文主要介绍了使用基于YOLOv5的单阶段检测器进行番茄植株表型分析的深度学习模型。实验使用一个高通量表型分析平台(HTP)进行,采用近红外 (NIR)、紫外线 (UV)、可见光 (RGB) 和专用于捕捉根部的特殊NIR相机获取植物的3D图像。基于上述表型获取平台,采集了复杂图像数据集,包含了15个番茄基因型在干旱胁迫下的茎节、果实和花朵的标注信息。本文选择了六种不同版本的YOLOv5模型进行比较,这些模型基于相同的基本架构,但在网络密度上有所不同,从而影响了检测精度和速度。使用了转移学习的方法,冻结了网络的主干部分,只训练了网络的头部部分,以适应数据集的特点。每个模型训练了300个周期,然后用精度、召回率和mAP等指标进行评估。结果发现,在单独使用各个模型时,YOLOv5x6模型在mAP上表现最好,达到了0. 883,但也有最慢的检测速度,为26. 2毫秒/张。YOLOv5s模型在检测速度上表现最好,为8. 9毫秒/张,但在mAP上表现最差,为0. 803。此外,还尝试了使用集成策略来提高检测效果,即将不同版本的YOLOv5模型的输出进行加权平均。结果显示,集成策略可以在一定程度上提升mAP和召回率,但也会降低精度和检测速度。文章还对不同类别的检测结果进行了分析,发现节点是最容易被检测出来的类别,而花朵是最难被检测出来的类别。这可能与数据集中各类别样本数量的不平衡以及图像中对象大小、相似性和颜色等因素有关。研究表明基于YOLOv5的单阶段检测器可以有效地识别番茄植株表型特征,尤其是节点、果实和花朵。展示了不同版本的YOLOv5模型之间在检测精度和速度上存在权衡关系,因此需要根据具体应用场景选择合适的模型,使用集成策略来提高检测效果的可能性和局限性。

 

这篇文章的创新点可以总结为:

  • 首次使用基于YOLOv5的单阶段检测器进行番茄植株表型分析,展示了该方法在处理具有挑战性的图像数据集方面的优势。

  • 全面比较和分析了不同版本的YOLOv5模型在检测精度和速度上的差异和权衡关系,为选择合适的模型提供了参考。

  • 尝试了使用集成策略来提高检测效果,并探讨了其可能性和局限性。

 

图1 计算机视觉注释工具(CVAT)提供的图形用户界面。用户可以在相关对象上手动插入边界框,然后使用适当的注释对其进行标记。

 

图2 基于YOLO架构的工作原理

 

图3 YOLOv5l6架构经过300代训练后的精确度、召回率和F1分数

 

图4  YOLOv5x6架构代训练后的精确度、召回率和F1分数

 

图5 YOLOv5+和YOLOv5+TTA的F1分数

 

图6 不同框架下的F1分数

 
 
来 源
Cardellicchio A, Solimani F, Dimauro G, et al. Detection of tomato plant phenotyping traits using YOLOv5-based single stage detectors[J]. Computers and Electronics in Agriculture, 2023, 207: 107757.
 

编辑

刘昕哲
 

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