Pheno-Parenting:基于深度学习的植物表型性状分析模型


发布时间:

2023-06-19

来源:

植物表型资讯

作者:

PhenoTrait

本文提出了一种基于深度神经网络的方法,用于分析和监测农业4.0中的植物生长情况。农业4.0是一种利用现代技术和数据驱动的农业模式,旨在监测植物的生命周期和特征,从而提高产量。本文引入了一种新的概念,称为植物亲子关系(pheno-parenting),它借鉴了植物表型鉴定(plant phenotyping)的一些方法,通过使用现代工具和技术来观察植物在不同生命周期阶段的表现,并支持它们的生长。本文建立了一个小型水培系统,用于收集和分析植物生命周期图像数据。该系统包括三种植物(矮牵牛、三色堇、金盏花),每种植物各有十株。本文基于深度神经网络完成植物种类识别、生长分析、健康分析、开花阶段识别。

 

植物种类识别:使用了卷积神经网络(CNN)来识别不同种类的植物,发现侧面图像比顶面图像更能有效地区分种类和追踪生长情况。金盏花在所有测试情况下都能被正确识别,准确率高于95%。生长分析:提出了一种生长发育指数(GDI)来衡量植物的生长情况,该指数随着营养液输入量的增加而先增加后饱和。发现不同种类的植物有不同的最佳营养液输入量,以及不同的生长速率和周期。健康分析:使用了基于纹理和颜色特征的图像处理方法,来检测植物叶片和花朵的健康状况。发现顶面图像比侧面图像更能捕捉叶片和花朵的纹理和颜色特征,从而更好地判断植物是否受到病虫害或缺水等影响。开花阶段识别:使用了基于形状特征的图像处理方法,来识别植物是否进入了开花阶段。

 

论文的创新之处在于:

  • 提出了一种新的概念,称为植物亲子关系(pheno-parenting),将植物表型鉴定与现代技术相结合,支持并优化植物的生长。

  • 提出了一种新的指标GDI,用于评估植物的生长情况,并发现不同种类的植物有不同的最佳营养液输入量。

  • 使用了基于深度神经网络的方法,完成了四个关键任务:植物种类识别、生长分析、健康分析、开花阶段识别,并发现侧面图像和顶面图像在不同任务上有不同的优势。

  • 建立了一个小型水培系统,收集并处理了三种植物在不同生命周期阶段的图像数据,为农业4.0中的数据驱动提供了一个实例。

     

    图片图1 基于计算机视觉的植物表型分析

 

图2 总体流程图

 

图 3 无土栽培系统

 

图4 数据集详情

图片图5 生长发育指数(GDI)的计算

 

图片图6 不同水培系统的 GDI 随时间变化

图片图7 2021年12月1日捕获的第三个水培系统测试用例的样本检测结果(侧视图,白天)。

 

 

来 源

Hati A J, Singh R R. AI-driven Pheno-parenting: A Deep Learning Based Plant Phenotyping Trait Analysis Model on a Novel Soilless Farming Dataset[J]. IEEE Access, 2023.

 

编辑

刘昕哲
 
 

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