学术中心
植物水分胁迫评估高光谱图像的光谱校正与降维
发布时间:
2023-06-29
来源:
植物表型资讯
作者:
PhenoTrait
高光谱成像(Hyperspectral Imaging,HSI)是一种新兴的植物表型分析技术,具有信息丰富、对植物无创等优点。然而,为了提高植物性状分析的准确性,需要解决光照效应和高维光谱特征等因素。本研究对光谱归一化和降维方法进行了探索和分析。本文的重点是双重的;第一个目标是探索用于光谱校正的标准正态变量(Standard Normal Variate,SNV)、最小绝对偏差(Standard Normal Variate,L1)和最小二乘(Least Squares,L2)归一化。第二个目标是探索主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)和Fisher方差检验分析(Analysis of Variance Fisher’s Test,ANOVA F-test)在光谱判别模型中降低光谱维数的可行性。利用玉米植株的HSI数据对分析技术进行了验证,以早期发现水分亏缺胁迫反应。结果表明,SNV在三种归一化方法中表现最好。此外,方差分析f检验改进了玉米植株水分亏缺响应的性状评价,优于PCA的波段选择方法。
图1 第一个数据集的处理流程
图2 第二个数据集的处理流程
图3 去除噪声带后的光谱
图4 高光谱图像呈现为RGB格式
图5 分割后的高光谱图像
图6 不同成像平台下SNV归一化光谱的k -均值簇(a)为0 mm, (b)为250 mm, (c)为350 mm, (d)为450 mm

图7 在不同的成像平台上,L1归一化光谱的k -均值簇显示在柱状图中:(a) 0 mm, (b) 250 mm, (c) 350 mm, (d) 450 mm
图8 在不同的成像平台上L2归一化光谱的k -均值簇显示在柱状图中:(a) 0 mm, (b) 250 mm, (c) 350 mm, (d) 450 mm
图9 (a) raw (b) SNV (c) L1和(d) L2光谱相似度结果,蓝色误差条代表对照组,红色误差条代表亏水组。
图10 1和10个原始光谱(a-b)和1和10个SNV归一化光谱(c-d)的光谱相似度结果基于PCA。蓝色误差条表示对照组,红色误差条表示亏水组。
图11 1和10pcs L1归一化光谱(a-b)和1和10pcs L2归一化光谱基于PCA的光谱相似度。蓝色误差条表示对照组,红色误差条表示亏水组。
图12 方差分析f检验后(a) raw (b) SNV (c) L1和(d) L2光谱相似度结果,蓝色误差条代表对照组,红色误差条代表亏水组。

图13 植被指数值(a) NDVI, (b) OSAVI, (c) PRI 550, (d)原始光谱上干旱植物检测的RENDVI。
Lin Jian Wen, Mohd Shahrimie Mohd Asaari and Stijn Dhondt. Spectral Correction and Dimensionality Reduction of Hyperspectral Images for Plant Water Stress Assessment. Pertanika Journal of Science & Technology, DOI: https://doi.org/10.47836/pjst.31.4.13
编辑
扩展阅读
推荐新闻
视频展示