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基于机器学习和先进无人机传感器系统融合预测干豌豆成熟度
发布时间:
2023-07-21
来源:
植物表型资讯
作者:
PhenoTrait
在干豌豆育种中,成熟度是一个重要的性状,但是目前常用的测量方法耗时、费力,而且容易出错。因此,一种更高效、准确的方法将有助于支持干豌豆育种项目。本文提出了一种利用机器学习算法和无人机系统(UASs)采集的数据来测量干豌豆成熟度的新方法。我们评估了五种机器学习算法(随机森林、人工神经网络、支持向量机、K-最近邻和朴素贝叶斯)在田间试验中准确预测干豌豆成熟度的能力。机器学习算法考虑了一系列变量,包括作物高度指标、窄带光谱和18种不同的颜色和光谱植被指数。我们采用了后向特征消除法来选择最重要的特征,通过迭代不断去除不显著的特征,直到模型的预测性能达到最优。研究结果表明,测量干豌豆成熟度最有效的方法是结合窄带光谱、红边、近红外(NIR)和基于RGB的植被指数,以及图像纹理指标和作物高度指标。随机森林模型的应用进一步提高了结果的准确性,显示出最高的准确性水平,三个指标精确度、召回率和f1分数都达到了0.99的值。敏感性分析表明,在预测豌豆成熟度时,光谱特征优于结构特征。虽然多光谱相机取得了最高的准确性,但是使用RGB相机也可能导致相对较高的准确性,在成本限制的情况下,可实用选择RGB相机。综上,本研究证明了将机器学习算法、UASs携带的LIDAR和多光谱数据相结合,可以准确地评估豌豆的成熟度。
图1 区分早熟和晚熟干豌豆地块的工作流程。
图2 (a)北达科他州在美国地图上的位置;(b) Prosper位于北达科他州;(c) 714个试验小区的概述;(d)早熟地块(黄色)和晚熟地块(蓝色)的位置。

图3 试验区去除阴影和从土壤背景中分割植被的示例图。(a)原始RGB图像;(b)过量绿色(ExG)图像显示了土壤和阴影像素;(c)植被像素用红色显示。
图4 种植后67(a)、84(b)和100(c)天早熟和晚熟干豌豆的光谱曲线
图5 通过后向特征消除方法确定的特征重要性。(a)NSP窄谱带;(b)CHM作物高度指标;(c)ITM图像纹理;(d)RGBVIs 基于rgb的植被指数;(e)NIRVIs近红外植被指数;(f)ReVIs红边植被指数。蓝色框表示重要性分数累加超过90%的特征。
图6 ROC曲线分析和AUC值,用于区分早熟和晚熟干豌豆植株的不同预测因子。
图7 不同的数据集下,不同机器学习算法(ANN—人工神经网络,KNN—K-最近邻,SVM—支持向量机,NB—朴素贝叶斯,RF—随机森林)估计干豌豆成熟度的预测精度。
图8 基于五种机器学习模型,对早熟和晚熟基因型在播种100天后,预测的和实际的成熟度空间位置比较图。
图9 特征选择前(灰色)和选择后(深蓝色)不同机器学习模型的稳定性分析。

图10 根据作物高度评估早熟和晚熟干豌豆。(a) RGB图像表示晚熟干豌豆植株(A)、地面(B)、早熟干豌豆植株(C)和i和ii横断面黑线。(b) 晚熟植株(A)、地面(B)、早熟植株(C)的三维横断面i–ii。(c)不同生长阶段早熟和晚熟干豌豆植株的平均植高变异性。
Bazrafkan A, Navasca H, Kim J H, et al. Predicting Dry Pea Maturity Using Machine Learning and Advanced Sensor Fusion with Unmanned Aerial Systems (UASs)[J]. Remote Sensing, 2023, 15(11): 2758.
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