新闻中心

资讯分类
您现在的位置:
首页
/
/
/
免费开源根系分析软件RhizoVision Explorer

免费开源根系分析软件RhizoVision Explorer

  • 分类:行业新闻
  • 作者:慧诺瑞德
  • 来源:本站
  • 发布时间:2020-11-06 14:02
  • 访问量:

【概要描述】

免费开源根系分析软件RhizoVision Explorer

【概要描述】

  • 分类:行业新闻
  • 作者:慧诺瑞德
  • 来源:本站
  • 发布时间:2020-11-06 14:02
  • 访问量:
详情

美国Noble研究所的年轻科学家Larry York近期发布了一款免费、开源的根系分析软件——RhizoVision Explorer。该软件有望实现根系图像中根与背景形成高对比度、照明均匀以及根系重叠最小化。该软件内置C ++,可以提高速度和稳定性,以QT为图形用户界面,以OpenCV进行图像处理。

 

通过使用一个物理铜线地面真实图像集、数千个模拟根以及与其他图像分析软件的比较,RhizoVision Explorer提取的性状已经得到广泛验证。默认的“断根”模式是指从土壤或花盆中断开的根系获取长度、体积、分枝频率等特征,并根据直径阈值存储测量值。“全根”模式能够提取较为完整根系的其他结构特征,尤其是挖出的根冠或根茎,例如凸包,角和孔。该软件支持多个根系部位、批处理和用户自定义的重叠功能的已处理图像的导出。

 

 

最低要求:Windows 10或8操作系统、Intel或AMD x86_64处理器和8GB内存。如果处理器支持Intel AVX 2.0,则代码将得到优化。

 

许可:您可以根据Noble通用公共许可证重新分配或修改它。

 

源代码:源代码可在GitHub上获得。

 

引用:软件开发者恳请您在演示和出版物中引用该软件时,请使用DOI表示可重复使用的版本。

 

Seethepalli,Anand,&York,Larry M.(2020年)。 RhizoVision Explorer-面向所有人的通用根图像分析交互式软件(版本2.0.2)。Zenodo. http://doi.org/10.5281/zenodo.4095629

 

请考虑在可公开访问的存储库中共享您的数据集、统计分析代码,甚至用于RhizoVision Explorer的设置文件,例如Zenodo,DataDryad,Figshare,CyVerse Data Commons或其他。

 

安装程序:下载下面的RhizoVisionExplorer-2.0.2-windows-x64.zip并将zip文件解压缩到本地目录并运行RhizoVisionExplorer.exe. Windows Defender或其他应用程序可能会提示您确认应用程序的安全性。

 

插图手册以PDF格式包含在RVE下载的manual文件夹中。

 

Imageexamples文件夹包括用RhizoVision Crown平台拍摄的小麦根冠PNG文件和扫描断开的小麦根系JPG文件,以供测试之用。

 

如果有任何疑问或意见,请联系创作者:

Anand Seethepalli

计算机视觉分析师

aseethepalli@noble.org

anand_seethepalli@yahoo.co.in

 

Larry M. York

Assistant Professor

lmyork@noble.org

 

下载链接:

ARhizoVisionExplorer-Screenshot.PNG

RhizoVisionExplorer-2.0.2-windows-x64.zip

关键词:

扫二维码用手机看

推荐新闻

高通量植物表型平台建设注意事项
高通量植物表型平台建设注意事项
发布时间 : 2022-05-20 11:45:57
育种,是在给定的环境条件下,选择各种表型指标(产量、品质、抗性)最优的基因型材料的过程(AI育种,从这里起步)。育种工作中大约70%的工作量来自表型观察测量和筛选,是最耗人力物力的过程。
查看详情
育种,是在给定的环境条件下,选择各种表型指标(产量、品质、抗性)最优的基因型材料的过程(AI育种,从这里起步)。育种工作中大约70%的工作量来自表型观察测量和筛选,是最耗人力物力的过程。
作物生理表型测量基础原理
作物生理表型测量基础原理
发布时间 : 2022-05-13 10:56:43
生理表型测量的核心在于“早、快”,要在肉眼可见之前就能测量并预判出变化趋势,才是这个技术的核心价值。叶绿素荧光成像,恰好满足了这个要求。
查看详情
生理表型测量的核心在于“早、快”,要在肉眼可见之前就能测量并预判出变化趋势,才是这个技术的核心价值。叶绿素荧光成像,恰好满足了这个要求。
AI育种,从这里起步
AI育种,从这里起步
发布时间 : 2022-05-09 12:21:00
植物表型本身就是一个跨学科领域,自带AI基因。而植物表型服务的对象就是育种和种植。AI通过植物表型赋能育种,是AI育种的重要发展方向之一。让我们用表型之“瞳”,赋农业之“慧”。
查看详情
植物表型本身就是一个跨学科领域,自带AI基因。而植物表型服务的对象就是育种和种植。AI通过植物表型赋能育种,是AI育种的重要发展方向之一。让我们用表型之“瞳”,赋农业之“慧”。
致即将毕业的你
致即将毕业的你
发布时间 : 2021-04-20 15:29:43
如果您有意向,不要彷徨不要犹豫,赶快将您的简历发到邮箱hr@phenotrait.com吧。
查看详情
如果您有意向,不要彷徨不要犹豫,赶快将您的简历发到邮箱hr@phenotrait.com吧。

视频展示

植物表型架起从数字农业到智慧农业的桥梁
00:30:11
所属分类:
视频展示
发布时间:
2020/12/10
关键词:

专题报道

搜索
确认
取消

联系我们

慧诺瑞德(北京)科技有限公司

地址:北京市海淀区西三旗街道建材城中路12号院8号楼2门 
电话:010-62925490829288548292886482928874
传真:010-62925490-802
Email:
info@phenotrait.com

邮编:100096

在线留言

关注我们

这是描述信息

植物表型圈

这是描述信息

植物表型资讯

慧诺瑞德(北京)科技有限公司版权所有      京ICP备15043840号    网站建设:中企动力   北二分     法律声明