基于地面激光雷达的小麦分蘖数计数方法


发布时间:

2020-11-14

来源:

本站

作者:

PhenoTrait

单位面积分蘖数是决定产量的主要农艺性状之一。对该性状的实时评估有助于监测小麦群体生长,或作为作物育种筛选品种的主要表型指标。然而,分蘖数的确定通常依赖于复杂的人工计数。本文提出了一种基于地面激光扫描(TLS)数据的田间分蘖密度自动计数算法。该算法包括两个步骤:(1)使用自适应分层(AL)算法进行聚类分割,(2)使用层次聚类(HC)算法进行聚类间分蘖检测。

 

基于TLS数据的分蘖数估计方法(ALHC)的工作流程

 

在中国江苏省如皋和徐州的两个生态点进行了三次田间试验,用20个不同的小麦品种、3种氮水平和两种种植密度对算法进行了验证。结果表明,该算法在不同品种、不同年份、不同生育期、不同种植密度和不同生态位点上都具有良好的应用前景。2016-2017年如皋、徐州和2017-2018年如皋的检验表明,该算法对小麦分蘖数的估计回归系数(R2)分别为0.61、0.56和0.65。总之,ALHC的分蘖计数通常低估了分蘖数,在植株密度较低、株型紧凑和拔节期的数据中表现得更好,这些数据与植株之间和浓密冠层内部的重叠和噪声有关。

 

算法示例

 

综上所述,本文提出的自动分蘖算法充分利用了作物的三维信息,开发了一种适合田间环境的自动分蘖计数方法。

 

试验a、b、c试验c的分蘖数估计结果

 

来源:

Fang Y, Qiu X, Guo T, et al. An automatic method for counting wheat tiller number in the field with terrestrial LiDAR. Plant Methods volume. https://doi.org/10.1186/s13007-020-00672-8.

推荐新闻

石时之约|韩志国:透过表型数据,看见植物的喜怒哀乐!

本期石时之约,我们将对话慧诺瑞德(北京)科技有限公司总经理、国际植物表型学会(IPPN)执委会委员/工业分会副主席韩志国,一起从表型数据的科学角度,去读懂农作物的喜怒哀乐和前世今生。

慧科研、慧育种、慧种田——慧聚改变的力量

让我们“慧聚”在一起,为“慧科研、慧育种、慧种田”赋能。

高通量植物表型平台建设注意事项

育种,是在给定的环境条件下,选择各种表型指标(产量、品质、抗性)最优的基因型材料的过程(AI育种,从这里起步)。育种工作中大约70%的工作量来自表型观察测量和筛选,是最耗人力物力的过程。

作物生理表型测量基础原理

生理表型测量的核心在于“早、快”,要在肉眼可见之前就能测量并预判出变化趋势,才是这个技术的核心价值。叶绿素荧光成像,恰好满足了这个要求。