RTip:一个用于测量间歇性干扰植物生长的全自动根尖追踪器


发布时间:

2020-12-22

来源:

本站

作者:

PhenoTrait

RTip是一种基于亚像素精度的分析高分辨率显微图像,定量植物根系生长速度的工具,是为在有间歇干扰的植物表型试验中进行高通量分析而设计的。RTip能够自动跳过某些人为干扰,例如当根尖不在显微镜下时,图像失真或模糊。

 

第0帧中的初始BB和第12帧中的RTip,CSRT,SiamDW,KCF和TLD的跟踪结果存在速度误差

 

结果显示,与六种跟踪算法(包括性能最好的无监督鉴别相关滤波器跟踪器和更深更广的连体网络)相比,RTip提供了最精确的根系生长速度,方差最小。本文还指出,RTip是唯一一个能够自动检测和恢复持续时间变化的扰动事件的跟踪器。

 

第1行和第3行中显示的根序列S1和S2的RTip结果以及第2行和第4行中每个帧的对应RT

 

来源:

Ufuktepe D K, Palaniappan K, Elmali M, et al. Rtip: A Fully Automated Root Tip Tracker For Measuring Plant Growth With Intermittent Perturbations. 2020 IEEE International Conference on Image Processing (ICIP).

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