学术中心

全部分类
您现在的位置:
首页
/
/
/
番茄地方品种的遗传多样性

番茄地方品种的遗传多样性

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
  • 发布时间:2020-12-31 06:10
  • 访问量:

【概要描述】

番茄地方品种的遗传多样性

【概要描述】

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
  • 发布时间:2020-12-31 06:10
  • 访问量:
详情

番茄(Solanum lycopersicum L.)是一种应用广泛的模式植物,可用于分离复杂性状的基因组基础,从而为现代组学研究和基因组育种提供一个最佳平台。全基因组关联研究(GWAS)已成为筛选大型多样性群体和性状的首选方法。本文对115个番茄地方品种和11个经典、现代品种进行了GWAS分析。

 

对所有形态学和果实品质性状进行主成分分析

 

以126个品种的遗传多样性为背景,分析了26个常规性状、40个数字表型性状、早熟和晚熟期的6个类胡萝卜素含量和21个气候相关变量。结合120个番茄品种的成熟果实转录测序获得的SNP多样性和表型分析获得的数据,确定与表型变异相关的基因组区域。本研究表明,利用果实RNA-Seq-SNP多样性不仅可以有效地识别果实性状变异的基因组区域,而且可以有效地识别与其他植物性状相关的变异以及对气候变化的适应性反应。此外,以前未鉴定的染色体区域被定位为潜在参与可变表型的表达。综上所述,本文进行的番茄采集是宝贵的多样性储藏库和基因发现的极好工具。

 

从结构(A)和DAPC(B)方法获得的种群结构分析

 

使用标准r2系数计算的所有染色体上的连锁不平衡衰减水平,并针对种群结构(rs2),亲属(rv2)以及种群结构和亲属关系(rvs2)校正了r2度量

 

来源:

Rodriguez M, Scintu A, Posadinu C M., et al. GWAS Based on RNA-Seq SNPs and High-Throughput Phenotyping Combined with Climatic Data Highlights the Reservoir of Valuable Genetic Diversity in Regional Tomato Landraces. Genes 2020, 11(11), 1387; https://doi.org/10.3390/genes11111387.

关键词:

扫二维码用手机看

推荐新闻

石时之约|韩志国:透过表型数据,看见植物的喜怒哀乐!
石时之约|韩志国:透过表型数据,看见植物的喜怒哀乐!
本期石时之约,我们将对话慧诺瑞德(北京)科技有限公司总经理、国际植物表型学会(IPPN)执委会委员/工业分会副主席韩志国,一起从表型数据的科学角度,去读懂农作物的喜怒哀乐和前世今生。
查看详情
本期石时之约,我们将对话慧诺瑞德(北京)科技有限公司总经理、国际植物表型学会(IPPN)执委会委员/工业分会副主席韩志国,一起从表型数据的科学角度,去读懂农作物的喜怒哀乐和前世今生。
慧科研、慧育种、慧种田——慧聚改变的力量
慧科研、慧育种、慧种田——慧聚改变的力量
让我们“慧聚”在一起,为“慧科研、慧育种、慧种田”赋能。
查看详情
让我们“慧聚”在一起,为“慧科研、慧育种、慧种田”赋能。
高通量植物表型平台建设注意事项
高通量植物表型平台建设注意事项
发布时间 : 2022-05-20 11:45:57
育种,是在给定的环境条件下,选择各种表型指标(产量、品质、抗性)最优的基因型材料的过程(AI育种,从这里起步)。育种工作中大约70%的工作量来自表型观察测量和筛选,是最耗人力物力的过程。
查看详情
育种,是在给定的环境条件下,选择各种表型指标(产量、品质、抗性)最优的基因型材料的过程(AI育种,从这里起步)。育种工作中大约70%的工作量来自表型观察测量和筛选,是最耗人力物力的过程。
作物生理表型测量基础原理
作物生理表型测量基础原理
发布时间 : 2022-05-13 10:56:43
生理表型测量的核心在于“早、快”,要在肉眼可见之前就能测量并预判出变化趋势,才是这个技术的核心价值。叶绿素荧光成像,恰好满足了这个要求。
查看详情
生理表型测量的核心在于“早、快”,要在肉眼可见之前就能测量并预判出变化趋势,才是这个技术的核心价值。叶绿素荧光成像,恰好满足了这个要求。

视频展示

透过表型数据看见植物的喜怒哀乐
00:59:21
所属分类:
视频展示
发布时间:
2022/11/13
关键词:

专题报道

本期石时之约,我们将对话慧诺瑞德(北京)科技有限公司总经理、国际植物表型学会(IPPN)执委会委员/工业分会副主席韩志国,一起从表型数据的科学角度,去读懂农作物的喜怒哀乐和前世今生。
搜索
确认
取消

联系我们

慧诺瑞德(北京)科技有限公司

地址:北京市海淀区西三旗街道建材城中路12号院8号楼2门 
电话:010-62925490829288548292886482928874
传真:010-62925490-802
Email:
info@phenotrait.com

邮编:100096

在线留言

关注我们

这是描述信息

植物表型圈

这是描述信息

植物表型资讯

慧诺瑞德(北京)科技有限公司版权所有      京ICP备15043840号    网站建设:中企动力   北二分     法律声明