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在对植物群体进行表型分析时,高通量比高精度能产生更好的决策

在对植物群体进行表型分析时,高通量比高精度能产生更好的决策

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
  • 发布时间:2021-04-02 06:10
  • 访问量:

【概要描述】在这个模拟研究中,我们比较了不同通量条件下的测量精度,并讨论了如何适当分配实验资源,可以通过通量增加来补偿错误率。

在对植物群体进行表型分析时,高通量比高精度能产生更好的决策

【概要描述】在这个模拟研究中,我们比较了不同通量条件下的测量精度,并讨论了如何适当分配实验资源,可以通过通量增加来补偿错误率。

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  • 作者:PhenoTrait
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传统上,评估植物群体表型的研究主要集中在提高测量精度和准确性。目前,利用成像、遥感和光谱学的表型分析方法会持续提高通量,但目前缺乏相关实验评估通量增加和测量精度可能下降之间的利弊。在这个模拟研究中,我们比较了不同通量条件下的测量精度,并讨论了如何适当分配实验资源,可以通过通量增加来补偿错误率。

 

环境和重复次数的增加对F3群体蓝色准确度的影响

 

环境和重复次数对F3群体RMSE的影响

 

结果显示,在通量增加的测试条件下,可以通过增加环境数量提高估计基因型的准确值。因此,遗传图谱研究应该增加群体规模。这种简单的模拟验证了了许多经验发现,对于任何对评估高通量表型分析方法如何影响作物研究项目决策感兴趣的研究人员来说,意义非凡。

 

增加环境和重复次数对F3群体重复性的影响

 

群体大小对F3群体QTL检测的影响

 

来源:

Holly M. Lane, Seth C. Murray. High Throughput can produce better decisions than high accuracy when phenotyping plant populations. Crop Science. https://doi.org/10.1002/csc2.20514.

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