利用高通量表型分析软件研究番茄种质资源的遗传多样性


发布时间:

2021-05-02

来源:

本站

作者:

PhenoTrait

番茄(Solanum lycopersicum L.)等作物由于驯化、育种和鲜食市场消费的人口瓶颈导致遗传变异的减少,因此增加了对这种经济作物保护和特性鉴定的需求。为研究伊朗国家植物基因库中这一宝贵遗传资源的遗传变异,本文采用半自动高通量技术对来自不同地区的589份番茄种质资源进行了鉴定。

 

番茄分析仪测定的性状分类

 

所有研究材料的典型果形品种

 

以果实形态为基础,将研究材料分为10个类群,各果实性状差异显著,表明不同地区种质资源具有丰富的多样性。采用层次聚类分析法将番茄种质资源分为9个主要类群。7个成分解释了超过83%的数据变异,两个很重要成分解释了50%的变异,其中果形指数和近/远端果形对第1个成分的变异贡献较大。这种独特的遗传多样性种质可用于选择感兴趣的番茄育种系。此外,杂种优势群材料还可用于番茄种质资源的杂交和保存,丰富番茄种质资源的育种前期工作。

 

用双标图显示了根据番茄分析仪特性分类的物种群

 

来源:

Marefatzadeh-Khameneh M, Fabriki-Ourang S, Sorkhilalehloo B, et al. Genetic diversity in tomato (Solanum lycopersicum L.) germplasm using fruit variation implemented by tomato analyzer software based on high throughput phenotyping. Genetic Resources and Crop Evolution (2021).

推荐新闻

石时之约|韩志国:透过表型数据,看见植物的喜怒哀乐!

本期石时之约,我们将对话慧诺瑞德(北京)科技有限公司总经理、国际植物表型学会(IPPN)执委会委员/工业分会副主席韩志国,一起从表型数据的科学角度,去读懂农作物的喜怒哀乐和前世今生。

慧科研、慧育种、慧种田——慧聚改变的力量

让我们“慧聚”在一起,为“慧科研、慧育种、慧种田”赋能。

高通量植物表型平台建设注意事项

育种,是在给定的环境条件下,选择各种表型指标(产量、品质、抗性)最优的基因型材料的过程(AI育种,从这里起步)。育种工作中大约70%的工作量来自表型观察测量和筛选,是最耗人力物力的过程。

作物生理表型测量基础原理

生理表型测量的核心在于“早、快”,要在肉眼可见之前就能测量并预判出变化趋势,才是这个技术的核心价值。叶绿素荧光成像,恰好满足了这个要求。