油棕榈的表型组学和基因组学:可持续高产优质油棕榈的前进之路


发布时间:

2021-06-03

来源:

本站

作者:

PhenoTrait

油棕(Elaeis guineensis Jacq.)是一种多年生异质作物,其基因组大小为1.8gb,繁殖周期长。目前,人类对植物油的需求正在稳步增长,预计到2050年可能需要近2.4-2.5亿吨。基因组学和下一代技术在实现油棕高产优质的可持续利用中起着至关重要的作用。油棕榈育种计划的成功与否取决于多样性基因库的可用性、迁地保护及其优良种植材料的合理利用。油棕育种方法主要有改良轮回选择法和改良相互轮回选择法。油棕产量及相关性状的QTL主要分布在染色体4、10、12和15上在4、10、14和15号染色体上可能有影响低高度增长的染色体区域。

 

研究所的资源块

 

油棕全基因组测序前后的基因组时间线

 

本文深入讨论了先进的基因组学方法和生物信息学工具,以实现油棕高产优质的可持续性。本文主要侧重于利用各种基因组工具的整体方法改进油棕作物。另外,本文还同时给出了基因组学里程碑的路线图,以及将油棕生产成高产优质油棕的发展方向。

 

油棕产量和产量性状的主要QTL的染色体定位

 

油棕与水稻染色体共线性的circos图

 

来源:

B. Kalyana Babu, R. K. Mathur, P. Anitha, G. Ravichandran & H. P. Bhagya. Phenomics, genomics of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.): way forward for making sustainable and high yielding quality oil palm. Physiology and Molecular Biology of Plants volume 27, pages 587–604 (2021). https://doi.org/10.1007/s12298-021-00964-w.

推荐新闻

石时之约|韩志国:透过表型数据,看见植物的喜怒哀乐!

本期石时之约,我们将对话慧诺瑞德(北京)科技有限公司总经理、国际植物表型学会(IPPN)执委会委员/工业分会副主席韩志国,一起从表型数据的科学角度,去读懂农作物的喜怒哀乐和前世今生。

慧科研、慧育种、慧种田——慧聚改变的力量

让我们“慧聚”在一起,为“慧科研、慧育种、慧种田”赋能。

高通量植物表型平台建设注意事项

育种,是在给定的环境条件下,选择各种表型指标(产量、品质、抗性)最优的基因型材料的过程(AI育种,从这里起步)。育种工作中大约70%的工作量来自表型观察测量和筛选,是最耗人力物力的过程。

作物生理表型测量基础原理

生理表型测量的核心在于“早、快”,要在肉眼可见之前就能测量并预判出变化趋势,才是这个技术的核心价值。叶绿素荧光成像,恰好满足了这个要求。