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CT在3D 植物成像中的应用
发布时间:
2021-09-04
来源:
植物表型资讯
作者:
PhenoTrait
本文主要回顾了用于植物成像的 X 射线 CT 领域的最新进展,并阐述了使用此类图像研究植物运输过程的可行性。
X射线计算机断层扫描 (CT) 是对植物组织和器官进行 3D 成像的优越工具。高分辨率 X 射线计算机断层扫描 (CT) 仪器越来越多地用于宏观、微观和纳米尺度的结构表型研究,包括植物发育和器官形态发生,以及维管束运输过程的模拟等研究中。
图1 X 基于射线计算机断层扫描 (CT) 成像的植物器官中的流体和溶质运输结构
相差显微、多光谱、暗场、软 X 射线和时间分辨成像正在涌现。其中,造影剂、相差显微和软X射线成像方面的新发展提高了图像对比度,并使以前无法分辨的结构特征可视化,使得特征更容易量化;时间分辨 X 射线 CT 技术的出现,实现了实时动态成像和图像重建。
图2 (A)果实显微结构3D可视化;(B)孔隙网络分析;(C)吸水动态的对比度增强X射线CT成像;(D)快速表型分析
大量可用的 3D 图像数据给数据管理也带来了挑战,基于机器和深度学习的自动图像处理算法开始出现,并取代传统繁琐的和手动操作的分割程序的图像处理方法。
来源:
Agnese Piovesan, Valérie Vancauwenberghe, Tim Van De Looverbosch, Pieter Verboven, Bart Nicolaï,X-ray computed tomography for 3D plant imaging, Trends in Plant Science, 2021,
编辑: 婷婷
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