见微知著:高光谱成像技术用于多年生树莓的QTL高通量检测


发布时间:

2021-09-16

来源:

本站

作者:

PhenoTrait

  生理和物理性状是许多作物特征的优质指标,但是精准地获取表型性状却是十分耗时的,从而限制了作物育种与作物监测的发展进步。该研究利用为多年生树莓种植园设计开发的高光谱成像平台,对超过两个生长季节的田间树莓定位群体进行高光谱图像获取以及作物评估,并对光谱数据进行了QTL分析。研究旨在探索建立光谱信息与田间作物的基因标记之间的联系,在不同的生长季节验证光谱QTLs的可重复性以及通过与已掌握的树莓物性状的QTLs的位置比较分析验证光谱QTLs的有效性。

 

图1 2016年8月份收集到的光谱数据的广义遗传力(图a展示了光谱单波段的遗传力,图b展示了光谱波段比值与主成分得分的遗传力)

 

  研究结果表明,多个波长的反射率强度与树莓已知的遗传标记存在相关性且在不同年份之间和生长季节时许多光谱特性存在遗传性。而且光谱特征与已测定的物理性状存在协同,例如光谱波段比719 nm / 691 nm与茎密度。除此之外,研究指出高光谱成像技术作为一种创新方法可以被用来高通量地获取树莓田间表型而且具有迁移至其他多年生作物研究的潜力。在农业大数据的背景下,该研究为建立与挖掘基因特征与光谱特征之间的联系提供了一种全新的方法思路。

  

     来源: Williams D, Hackett CA, Karley A, et al. Seeing the wood for the trees: hyperspectral imaging for high throughput QTL detection in raspberry, a perennial crop species. Fruit Research Volume 1, Article number: 7 August 2021. https://doi.org/10.48130/FruRes-2021-0007.

 

   编辑:张金诺

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