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表型数据管理和信息共享:加拿大表型平台P2IRC的解决方案

表型数据管理和信息共享:加拿大表型平台P2IRC的解决方案

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
  • 发布时间:2021-11-13 06:10
  • 访问量:

【概要描述】本文提供了一些建议,使数据管理员能够从语义、语法/技术和法律的角度实现数据的互操作,从而保护和改进数据和元数据的内容、可发现性、可访问性和可用性。治理框架将有助于开放研究成果的所有方面,同时实现获取和利益分享(ABS)目标,并有助于保护和可持续利用D&I。

表型数据管理和信息共享:加拿大表型平台P2IRC的解决方案

【概要描述】本文提供了一些建议,使数据管理员能够从语义、语法/技术和法律的角度实现数据的互操作,从而保护和改进数据和元数据的内容、可发现性、可访问性和可用性。治理框架将有助于开放研究成果的所有方面,同时实现获取和利益分享(ABS)目标,并有助于保护和可持续利用D&I。

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  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
  • 发布时间:2021-11-13 06:10
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  高通量植物表型是一个跨学科的研究领域,它提供了一种系统的方法来评估和了解植物的生命周期,旨在将植物基因型与植物生理生态和农学相结合。共享数据和信息(data and information,D&I)是加速植物表型新科学突破和创新的关键。治理和管理框架的开发可以克服限制D&I共享的制度、法律和技术障碍。这个框架控制了关于D&I的决策如何做出,研究人员如何相互参与以管理D&I,并从不同来源改进D&I的内容、可发现性、可访问性和可用性。

 

  尽管共享研究D&I可以带来广泛认可的价值,但重大的制度、法律和技术障碍仍有待解决,尤其是在管理跨学科研究方面。植物表型和成像研究中心(Plant Phenotyping and Imaging Research Centre,P2IRC)提供了一个具有启发性的案例研究,研究人员如何交换他们的D&I,以适应跨学科研究的要求。

 

  P2IRC的目标是利用高通量植物表型(来自受控环境和田间试验)来揭示调节作物生长的生物过程,并促进植物育种以提高气候适应力和生产力(特别是谷物、油籽和豆类)。为了实现其目标,P2IRC邀请了来自不同学科的研究人员,包括植物科学、土壤科学、数据科学(特别是计算机科学和数学)、物理、化学、工程和社会科学,共同努力促进作物表型的创新。P2IRC还与加拿大和国际大学以及一些私营和公共部门的合作伙伴合作,以加速表型研究,并在基础研究和应用研究之间建立一座桥梁。作为一个跨学科项目,P2IRC处理来自不同格式和来源的多维数据的快速积累。数据类型包括来自野外和气候控制环境的表型、遥感图像、根表型出现、基因组学、土壤、现场试验结果、实验报告、收获(来自产量监测和田间收获)、气象站数据、气候数据以及农场调查和统计。

 

  社会网络分析(social network analysis,SNA)被用来检查P2IRC研究人员之间以及P2IRC研究人员与合作伙伴和P2IRC之外的其他合作者之间的D&I共享的现状,如图1和图2。本文发现D&I分享是适度的,大多数交流发生在学术研究人员之间,主要是在同一学科内。由于缺乏广泛传播所带来的好处,学者们并没有最佳地分享他们的D&I。许多研究人员发现了限制共享的一系列障碍。这些障碍主要根源于D&I治理和管理的缺失。

 

  图1 P2IRC内的数据和信息共享(节点大小表示研究者活动的程度,颜色表示学科)

 

  图2 跨P2IRC的数据和信息共享:P2IRC研究人员、合作伙伴组织和其他合作者

  为了克服障碍,本文为制定治理和管理框架提供了建议和解决方案,该框架适合于P2IRC项目,但与更广泛的研究领域相关。这包括如何协助采用治理模式、问责和监督机制,以及有效收集、分析、拥有和传播数据的操作框架,如图3。

  本文提供了一些建议,使数据管理员能够从语义、语法/技术和法律的角度实现数据的互操作,从而保护和改进数据和元数据的内容、可发现性、可访问性和可用性。治理框架将有助于开放研究成果的所有方面,同时实现获取和利益分享(ABS)目标,并有助于保护和可持续利用D&I。

 

  图3 数据治理和管理组件

 

  来源 : Lana Awada, Peter W. B. Phillips, Ana Maria Bogdan. Governance and stewardship for research data and information sharing: Issues and prospective solutions in the transdisciplinary plant phenotyping and imaging research center network. Plants, People, Planet, 2021, 1-12. https://doi.org/10.1002/ppp3.10238

  

  编辑 : 王春颖

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