整合基因组学和表型组学方法支撑植物遗传资源的保护与利用


发布时间:

2021-12-31

来源:

本站

作者:

PhenoTrait

  植物基因库为全球的育种和相关研究提供了广泛的植物遗传多样性。研究者们受益于这些高质量、标准化的植物表型与基因型数据。整合不同数据类型与分析工具的数据库与记录标准化数据收集方法的数据库将有助于植物遗传资源(PGR)的多样性研究。本文讨论了在数据收集和记录中考虑基因库种质资源同质性和异质性的重要性。通过实例引用,本文描述了详细记录的基因组学和表型组学数据如何满足植物遗传资源管理者和使用者的需求。基于标准化方法和评级系统的数据表征与评估有助于更快地寻找到合适的种质资源。该研究探索性地概括了由植物遗传资源信息系统改进而可能带来的新的发展方向。在未来,基因库用户将越来越需要访问高质量的基因组学和表型组学数据以获取足够数量的遗传多样性信息。植物基因库的遗传资源信息系统必须朝向用户友好型方向发展,并具有一定适应性和可拓展性以支持新的基因组学和表型组学技术。

 

  图1基因库的运作过程

 

  图2甜菜三级基因库的等位基因挖掘

 

  图3 海棠果的图像(红色的果实不是这个物种的特征。将通过测序的基因分型来确定分类单元)

 

  来源:Volk, G.M.; Byrne, P.F.; Coyne, C.J.; Flint-Garcia, S.; Reeves, P.A.; Richards, C. Integrating Genomic and Phenomic Approaches to Support Plant Genetic Resources Conservation and Use. Plants 2021, 10, 2260. https://doi.org/10.3390/plants10112260

 

  编辑:张金诺

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