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利用开源的云表型系统(OPEN Leaf)跟踪叶片对养分有效性响应的动态变化

利用开源的云表型系统(OPEN Leaf)跟踪叶片对养分有效性响应的动态变化

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
  • 发布时间:2021-11-26 06:10
  • 访问量:

【概要描述】作为一个概念验证,我们报告了OPEN Leaf跟踪植物在不同营养水平下水培生长时的大小和颜色变化的能力。我们期望开源的HTP平台结合科学界标准化的实验条件,推动对植物营养吸收和分配基因和网络的识别。

利用开源的云表型系统(OPEN Leaf)跟踪叶片对养分有效性响应的动态变化

【概要描述】作为一个概念验证,我们报告了OPEN Leaf跟踪植物在不同营养水平下水培生长时的大小和颜色变化的能力。我们期望开源的HTP平台结合科学界标准化的实验条件,推动对植物营养吸收和分配基因和网络的识别。

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:本站
  • 发布时间:2021-11-26 06:10
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  微量营养元素,如铁、锌和硫,在植物或者人类的生长中发挥着重要作用。了解植物如何感知和分配其组织内的营养物质,能够为开发具有高营养价值的植物提供理论基础。尽管经过了几十年的深入研究,但是拟南芥中超过40%的基因仍未得到表征或者没有指定的功能。虽然一些资源,如突变群体或者多样性的小组提供了识别植物营养中至关重要基因的可能性,但是以自动、全面的方式持续跟踪和评估植物生长的能力仍然是一个主要的限制。高通量表型(HTP)是植物学的新标准,但很少有HTP系统是开源和用户友好型的。因此,我们开发了OPEN Leaf,一个用于水培实验的开源HTP。OPEN Leaf能够跟踪整个植物或者特定区域的大小和颜色变化。我们还整合了通讯平台(Slack)和云服务(CyVerse),以方便用户实时沟通、协作、数据存储和分析。作为一个概念验证,我们报告了OPEN Leaf跟踪植物在不同营养水平下水培生长时的大小和颜色变化的能力。我们期望开源的HTP平台结合科学界标准化的实验条件,推动对植物营养吸收和分配基因和网络的识别。

 

  图1 (a)通过高分辨率摄像头结合OPEN Leaf对未定性的植物进行表征,(b)与Slack结合实现系统远程工作

 

  图2 整株分析显示了整个植物按面积和颜色增长的宏观趋势

 

  图3 叶子的具体分析提供了对营养物质的新认识

 

  来源 : Swartza L G. Tracking dynamic changes of leaves in response to nutrient availability using an open-source cloud-based phenotyping system (OPEN Leaf)[J]. 2021.

  https://doi.org/ 10.1002/essoar.10508290.1

 

  编辑 : 小王博士在努力

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