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结合基因组选择和温室表型加速林木育种

结合基因组选择和温室表型加速林木育种

  • 分类:植物表型资讯
  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:植物表型资讯
  • 发布时间:2020-09-29 06:10
  • 访问量:

【概要描述】本研究使用了一组数据集,包括温室和田间收集的三角杨种群DNA基因型和纵向生长测量数据,以评估大规模温室表型与常规GS相结合的潜在影响。

结合基因组选择和温室表型加速林木育种

【概要描述】本研究使用了一组数据集,包括温室和田间收集的三角杨种群DNA基因型和纵向生长测量数据,以评估大规模温室表型与常规GS相结合的潜在影响。

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  • 作者:PhenoTrait
  • 来源:植物表型资讯
  • 发布时间:2020-09-29 06:10
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林木育种是一个成本高昂且缓慢的过程,需要长时间(如5年)的大规模田间试验来测量经济和环境相关的表型(如成年植物生物量或株高)。基因组选择(GS)和利用早期表型间接选择(例如温室条件下收集的表型)是加速树木育种的两种方法。这两种方法既可以减少田间试验的成本,又可以减少做出选择决策所需时间。

 

使用了四种预测方法以及相应的训练和测试集

 

通过基于单个温室测量的间接表型选择(第1-15周,第1-15周,第1-15周),三角杉田间株高(第1-5年,Y.1,Y.2,Y.3,Y.4和Y.5年)的选择精度

 

本研究使用了一组数据集,包括温室和田间收集的三角杨种群DNA基因型和纵向生长测量数据,以评估大规模温室表型与常规GS相结合的潜在影响。结果发现,该方法可以提供比较准确的早期选择决策。因此可以得出结论:结合温室表型、GS以及缩短世代间隔的繁殖技术,可以空前加快三角杉和其他商业树种的育种过程。

 

三角杉种群预测的平均遗传力、预测与选择目标之间的平均遗传相关以及选择精度

 

来源:

Filipe C. Alves, Kelly M. Balmant, Marcio F. R. Resende Jr, et al. Accelerating forest tree breeding by integrating genomic selection and greenhouse phenotyping. The Plant Genome. https://doi.org/10.1002/tpg2.20048.

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